Con apenas un tercio de los países europeos cumpliendo los objetivos de seguimiento de las variantes de Covid-19, las empresas de diagnóstico y genómica están luchando por afrontar este desafío.

Nuevas cepas del coronavirus Covid-19 invaden Europa a medida que continúan los esfuerzos de distribución de vacunas. Estas variantes a menudo ganan fuerza cuando las mutaciones las hacen más virulentas o cuando se propagan más rápido que la cepa original. Algunas cepas pueden eventualmente volverse resistentes a las vacunas actuales.

La secuenciación regular de las cepas de Covid-19 circulantes puede identificar variantes cuestionables en una etapa temprana. Las secuencias también se pueden utilizar para adaptar vacunas a cepas futuras.

Sin embargo, solo nueve de los 28 países de la Unión Europea y el Espacio Económico Europeo cumplieron el objetivo de secuenciación recomendado por el Centro Europeo para la Prevención y el Control de Enfermedades (ECDC). A finales de febrero, solo Bélgica, Dinamarca, Finlandia, Alemania, Islandia, Irlanda, Italia, Luxemburgo y Noruega habían alcanzado el 10% o 500 o más muestras aleatorias secuenciadas por semana.

«Tenemos varios países europeos que no están … a un nivel que les permite identificar, monitorear y, por lo tanto, controlar rápidamente las variantes afectadas.“, Dijo el responsable de la supervisión del ECDC, Bruno Ciancio, esta semana a la Comisión de Medio Ambiente, Salud Pública y Seguridad Alimentaria del Parlamento Europeo.

«Es bueno ver que la capacidad está aumentando en diferentes Estados miembros con el tiempo, pero muchos están lejos del objetivo.. «

Las empresas de biotecnología están trabajando arduamente para identificar tres variantes principales, que llevan el nombre de la ubicación donde se identificaron por primera vez en el Reino Unido (B117), Sudáfrica (B1351) y Brasil (P1). Estas empresas también identifican nuevas mutaciones de virus potencialmente preocupantes a través de la colaboración, la diversificación y la innovación.

La empresa alemana Centogene, cuya actividad principal son las pruebas de detección de enfermedades raras, es una de esas empresas. La compañía ofrece una cartera de pruebas Covid-19 en 10 centros de atención ambulatoria alemanes, incluida la prueba de PCR estándar de oro.

Volkmar Weckesser, director de información de Centogene, dijo que el comportamiento de las nuevas variantes, por ejemplo con respecto al riesgo de infección, solo podría conocerse después de que fueran descubiertas. Por lo tanto, si las pruebas de la compañía detectan el virus Covid-19 en una muestra, Centogene realizará una secuenciación para obtener los datos genéticos completos.

«Esperamos ofrecer una imagen no solo de la evolución del número de infecciones en general, sino también de la evolución del virus en sí como base para una respuesta política adecuada.«Dijo Weckesser.

Sin embargo, la empresa cree que la secuenciación de muestras virales en Alemania puede verse obstaculizada debido a la falta de recursos. Por ejemplo, el gobierno federal solo financia la secuenciación de muestras que no tienen más de una semana de antigüedad.

Prueba de genómica Covid-19

En el Reino Unido, la empresa de genómica Nonacus ha lanzado un servicio completo de secuenciación del genoma tras recibir una subvención de Innovate UK. Las pruebas de detección genómica están diseñadas para ser más rápidas y económicas que los servicios actuales. Estas pruebas se utilizan para verificar variantes cuestionables en todas las muestras de viajeros internacionales que dieron positivo el segundo día después de llegar al Reino Unido.

Más lejos, en Corea del Sur, Seegene ha estado trabajando día y noche para desarrollar una nueva prueba de PCR que puede buscar Covid-19 e identificar múltiples mutaciones en un solo paso. Esto podría facilitar y acelerar el seguimiento de las variantes afectadas que la secuenciación del genoma completo.

Estas pruebas se están comprobando actualmente para su aprobación europea. Seegene espera que el proceso se complete a fines de marzo. Las pruebas se entregarán en abril.

Seegene afirma que monitorear y rastrear nuevas variantes debido a la falta de información presenta desafíos especiales y no puede predecir en qué dirección mutará el virus.

«Desarrollar una prueba de variante de Covid-19 es bastante difícil en comparación con el desarrollo de una prueba de diagnóstico de tipo salvaje de Covid-19«Dijo un representante de Seegene.

«La tecnología tradicional se puede utilizar para detectar una sola variante, pero no múltiples variantes en una sola prueba.. Más recientemente, sin embargo, Seegene ha podido desarrollar una prueba de variante de coronavirus que utiliza nuestra exclusiva tecnología de multiplexación alta para detectar múltiples variantes del virus Covid-19 y virus de tipo salvaje en un solo tubo.. «

El ECDC desarrolla pautas específicas para la secuenciación que se adaptan a cada nueva variante. Utiliza datos de la secuenciación del genoma que se comparten en la UE y con socios internacionales.

Junto con la Comisión Europea, el ECDC también apoya el seguimiento y control de la aparición de variantes, por ejemplo, la secuenciación para países que tienen dificultades para implementarlas.

El servicio comenzó en febrero y tiene como objetivo secuenciar 15.000 o más muestras por semana, ya que las organizaciones también buscan aumentar la capacidad de los estados miembros de manera sostenible.

Hasta la fecha, ha habido más de 23 millones de casos de Covid-19 en la UE y el EEE y más de dos millones y medio de muertes en la región. A medida que mejoran la tecnología y la logística para las pruebas y el cribado de muestras, los sistemas de salud pueden controlar mejor los brotes al tiempo que reabren gradualmente la economía.


Imagen de portada de Elena Resko

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