El Centro Nacional Danés del Genoma se ha asociado con la empresa británica Lifebit para mejorar el acceso y el intercambio de datos del genoma a medida que el país avanza hacia la adopción de la medicina personalizada.

La medicina personalizada está atrayendo la atención de las autoridades sanitarias de todo el mundo. Al recopilar secuencias genómicas de poblaciones de pacientes, los investigadores pueden filtrar grandes conjuntos de datos para encontrar los tratamientos más baratos y seguros para personas con una composición genética específica. Iniciativas como EP PerMed de toda la UE, Genomics England y el Danish National Genome Centre (DNGC) están trabajando para iniciar la transición a la medicina basada en datos.

Sin embargo, a menudo hay muchos centros y biobancos diferentes que analizan los datos de salud de los pacientes utilizando diferentes software y métodos, lo que crea un sistema fragmentado. También puede ser difícil mover datos entre centros sin comprometer la privacidad y seguridad del paciente.

Esta semana, la DNGC encargó a la empresa británica Lifebit que resolviera los desafíos típicos del intercambio de datos con su software basado en la nube. Lifebit conecta virtualmente proveedores de datos como instalaciones de genómica y biobancos en un llamado sistema federado. Esto permite a los investigadores acceder y procesar datos de pacientes sin tener que mover los datos entre centros.

El objetivo inmediato del DNGC es secuenciar 60.000 genomas de pacientes para 2024. Bajo un contrato de cuatro años, la tecnología de Lifebit se utilizará para mejorar las capacidades de intercambio de datos del clúster de supercomputación de DNGC. También podría vincularse con otros proyectos nacionales de medicina personalizada, como los de Genomics England, France Genomique y Genomic Medicine Sweden.

«Este entorno de investigación confiable y federado permitirá a los investigadores colaborar de manera más efectiva en este rico conjunto de datos a escala e impulsar la colaboración internacional entre otras iniciativas gubernamentales, muchas de las cuales ya aprovechan la tecnología federada de Lifebit.Thorben Seeger, Director de Desarrollo de Negocios de Lifebit, en un comunicado público.

Lifebit es uno de los muchos especialistas en bioinformática que llaman la atención de los inversores en Europa. En septiembre de 2021, la empresa recaudó más de 50 millones de euros en una ronda Serie B para impulsar su expansión global. Otros esfuerzos para vincular los centros de genómica en un enfoque federal incluyen la IA viral de DNAstack, que tiene como objetivo mejorar la vigilancia de los patógenos virales, y el programa Digital Europe, que tiene como objetivo mejorar el intercambio de datos de salud en la UE.

Las grandes compañías farmacéuticas se están volviendo cada vez más activas en la recopilación de conjuntos de datos genómicos para aumentar sus actividades de descubrimiento de fármacos. AstraZeneca, por ejemplo, está ejecutando un proyecto para secuenciar dos millones de genomas para tratar enfermedades raras. Mientras tanto, Boehringer Ingelheim se unió a una iniciativa para secuenciar 500 000 genomas de biobancos finlandeses en octubre de 2021 y se asoció con Lifebit en marzo de este año para fortalecer las capacidades informáticas de la compañía farmacéutica en genómica.

Imagen de portada a través de Shutterstock

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