El control de las células inmunitarias es esencial para casi todos los estudios clínicos. El problema: los métodos actuales requieren células viables, una demanda que a menudo se ve obstaculizada por la logística de muestras.

Eva Raschke, precisión para la medicina
Eva Raschke, Directora de Asuntos Científicos de Precision for Medicine

¿Qué tienen en común el cáncer, las enfermedades autoinmunes y el Covid-19? Sugerencia: piense en las células inmunitarias.

En inmunooncología, los enfoques terapéuticos provocan una respuesta inmunitaria dirigida contra el tumor. En las enfermedades autoinmunes, una respuesta desregulada del sistema inmunitario ataca las células del cuerpo. Con Covid-19, las complicaciones graves se atribuyen a la actividad de las células inmunitarias en lugar de a la toxicidad del virus.

Por lo tanto, el control del estado de las células inmunitarias es esencial para estudiar estas condiciones. En los ensayos clínicos, el seguimiento de la actividad de las células inmunitarias y la composición cambiante de los diferentes tipos de células inmunitarias ayuda a los investigadores a comprender qué sucede en cada etapa de la enfermedad, a diseñar nuevas terapias y a evaluar la eficacia de los medicamentos.

desafíos logísticos

La citometría de flujo es el método estándar actual para monitorear las células inmunitarias. Analiza células enteras utilizando biomarcadores de proteínas de superficie. Sin embargo, estas proteínas suelen ser frágiles. Si las células se dañaron durante la recolección, el transporte o el almacenamiento de muestras, ya no se pueden analizar.

“Las muestras clínicas siempre han sido un desafío logístico. Las celdas que pierden su forma o viabilidad durante el transporte pueden afectar gravemente la calidad de los datos o incluso imposibilitar el análisis de estas celdas. En casos extremos, más de la mitad de las celdas pueden destruirse, lo que afecta significativamente la calidad de los datos». declaró Eva Raschke, directora de asuntos científicos de Precision for Medicine, una organización mundial de investigación clínica.

Epigenética para monitorear las células inmunes

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El flujo de trabajo de identificación de Epiontis

El laboratorio Epiontis con sede en Berlín (ahora conocido como Precision for Medicine GmbH) fue adquirido por Precision for Medicine en 2017 y desarrolló la tecnología Epiontis ID para monitorear las células inmunitarias. Epiontis ID no requiere células viables que puedan resultar dañadas por los procesos logísticos.

En su lugar, se analizan las características epigenéticas en el ADN de las células inmunitarias, en particular, la presencia de grupos metilo en las bases de citosina. Estas modificaciones son características de ciertos tipos de células inmunitarias, por lo que los patrones de metilación pueden estar directamente relacionados con la composición de células inmunitarias en una muestra.

En el flujo de trabajo totalmente automatizado y acreditado de Epiontis ID, el ADN aislado se trata con reactivos de bisulfito que convierten todas las bases de citosina no metiladas en uracilo, mientras que las citosinas metiladas no se ven afectadas. Los cambios resultantes en la secuencia de ADN se detectan mediante PCR cuantitativa, lo que permite determinar el número de tipos de células inmunitarias específicas.

Datos estandarizados para colaboraciones globales y un paso atrás en el tiempo

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Precisión para la ubicación del laboratorio de Medicina en Berlín

Precision for Medicine, que cuenta con otros seis laboratorios especializados en Europa y EE. UU. además del laboratorio de Berlín, respalda la investigación de precisión clínica impulsada por biomarcadores con servicios de laboratorio especializados y tecnologías desarrolladas internamente.

Actualmente, los clientes pueden crear un panel individual de células inmunitarias a partir de una selección de más de 30 marcadores prevalidados. Los informes estandarizados enumeran el porcentaje de tipos de células individuales en una muestra, así como el número absoluto de células presentes por muestra µsangre En el caso de grandes estudios clínicos, los datos también se pueden transferir directamente a la base de datos del cliente.

Debido a que los datos basados ​​en el ADN son altamente reproducibles, se pueden comparar entre cohortes y sitios de estudio, lo que permite a los investigadores interactuar globalmente. Además, los nuevos resultados se pueden comparar con los datos de estudios anteriores para su reevaluación, como retroceder en el tiempo.

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Epiontis-ID realizado en el laboratorio de Berlín

En comparación con las proteínas de superficie, las moléculas de ADN son muy estables, por lo que la tecnología de identificación de Epiontis no se limita a muestras de sangre fresca. También trabaja con todo tipo de muestras de tejido (frescas, congeladas o incluidas en parafina), manchas de sangre seca y saliva, independientemente de las condiciones de almacenamiento.

En respuesta a la pandemia actual, incluso se están analizando frotis de garganta para examinar el efecto del virus SARS-CoV-2, que causa el Covid-19, directamente en el sitio de infección.

“Estamos entusiasmados con un proyecto de investigación interno en curso que utiliza la tecnología de vigilancia ID de Epiontis para intentar predecir la progresión de la enfermedad en pacientes con Covid-19”. explicó Raschke.

superar fronteras

La inmunovigilancia basada en ADN supera las tres limitaciones principales de los métodos actuales basados ​​en células: estabilidad de la muestra, tipo de muestra y estandarización. Hasta la fecha, la tecnología ID de Epiontis se ha utilizado en más de 100 estudios clínicos con casi 70 000 muestras analizadas. Y tal vez la próxima terapia innovadora se desarrolle gracias al monitoreo epigenético de células inmunitarias, de un laboratorio de Berlín.

¿Está interesado en ampliar las fronteras de la monitorización de células inmunitarias para su próximo ensayo clínico? Visitar Visite el sitio web de Epiontis ID o mire este video para obtener más información sobre la tecnología.

Este artículo se publicó originalmente en septiembre de 2020 y desde entonces se ha actualizado.

Imagen de portada a través de Shutterstock.com e imágenes del artículo a través de Precision for Medicine

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